Optimasi Primer yang Menargetkan Gen OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2 Menggunakan qPCR
نویسندگان
چکیده
qPCR merupakan metode yang akurat untuk mendeteksi ekspresi gen. Analisis gen pengkode faktor transkripsi pada padi saat ini banyak dilakukan. OsAP2, OsERF3 dan OsEREBP2 termasuk kedalam kelompok AP2/ERF berperan penting dalam proses biologis tanaman. Penelitian mengenai analisis Cempo Ireng belum pernah Dalam melakukan menggunakan RT-PCR dibutuhkan primer spesfiik sesuai dengan diinginkan. Primer salah satu komponen PCR. Gagalnya penempelan tahapan annealing menyebabkan kegagalan amplifikasi. Optimasi perlu dilakukan mendapatkan suhu optimal. Pada penelitian akan optimasi anealing 3 yakni OsEREBP2. cDNA sebagai template. Konfirmasi hasil elektroforesis. Hasil menunjukkan bahwa optimal berada kisaran 53,9 – 60 °C.
منابع مشابه
Yang Dan
Yang Dan Howard Hughes Medical Institute and the University of California, Berkeley Yang Dan is a Paul Licht Distinguished Professor in Biology and an Investigator of the Howard Hughes Medical Institute at the University of California, Berkeley. She grew up in Beijing and studied physics as an undergraduate student at Peking University. She conducted her PhD research in the lab of Mu-ming Poo a...
متن کاملqPCR primer design revisited
Primers are arguably the single most critical components of any PCR assay, as their properties control the exquisite specificity and sensitivity that make this method uniquely powerful. Consequently, poor design combined with failure to optimise reaction conditions is likely to result in reduced technical precision and false positive or negative detection of amplification targets. Despite the f...
متن کاملKlasifikasi Data Cardiotocography Dengan Integrasi Metode Neural Network Dan Particle Swarm Optimization
Backpropagation (BP) adalah sebuah metode yang digunakan dalam training Neural Network (NN) untuk menentukan parameter bobot yang sesuai. Proses penentuan parameter bobot dengan menggunakan metode backpropagation sangat dipengaruhi oleh pemilihan nilai learning rate (LR)-nya. Penggunaan nilai learning rate yang kurang optimal berdampak pada waktu komputasi yang lama atau akurasi klasifikasi yan...
متن کاملPolymorphisms in the pfcrt and pfmdr1 genes in Plasmodium falciparum isolates from South Sumatera, Indonesia
Metode: Studi molekuler dilakukan untuk mengidentifikasi alel mutan dua gen yang berhubungan dengan resistensi klorokuin pada isolat P. falciparum di Sumatera Selatan. Sebanyak 25 pasien diambil darahnya, kemudian dilakukan isolasi DNA. Susunan dari kedua gen (Plasmodium falciparum chloroquine resistance transporter/pfcrt dan Plasmodium falciparum multidrug resistance/pfmdr1) dianalisis dengan ...
متن کاملDesain dan Implementasi Face Recognition dan Live Streaming pada Sistem Digital Assistant untuk Staf Medik Fungsional menggunakan Google Glass
Abstrak— Dalam era globalisasi saat ini, rumah sakit dituntut untuk meningkatkan kinerja dan daya saing sebagai badan usaha dengan tidak mengurangi misi sosial yang dibawanya. Hal ini berarti bahwa rumah sakit harus menerapkan kebijakankebijakan strategis agar mampu secara cepat dan tepat dalam pengambilan keputusan sehingga dapat menjadi organisasi yang responsif, inovatif, efektif, dan efisie...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Bioeksperimen: jurnal penelitian biologi
سال: 2022
ISSN: ['2460-1365', '2527-2799']
DOI: https://doi.org/10.23917/bioeksperimen.v8i1.15800